Após o fim da Terceira Guerra Ninja, a Vila da Folha fica dividida entre Orochimaru de Danzou e Namikaze Minato do Terceiro para ocupar o posto de Quarto Hokage. Enquanto isso, Kakashi é assombrado pela morte de seus amigos, Obito e Rin, o que acaba tirando o seu foco durante suas missões e o colocando em perigo.