Kaji se revela um espião infiltrado na NERV. Enquanto isso, Misato e Ritsuko vão a uma festa de casamento e lamentam ainda estarem solteironas, ao mesmo tempo em que Shinji e seu pai visitam o túmulo de sua mãe, Yui Ikari. No Dogma Central da NERV, o comandante Ikari faz estranhas experiências com Rei. Kaji, espionando o local, é surpreendido por Misato, porém os dois fazem uma estarrecedora descoberta: O primeiro Anjo, Adão, que veio para a Terra há quinze anos, estava preso na central da NERV.